Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc61Q3UJV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms