Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp19Q3UJD6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms