Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf224Q3UIW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf224Q3UIW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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