Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx3lQ3UIR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms