Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Greb1Q3UHK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms