Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed8Q3UHI4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms