Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms