Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otud5Q3U2S4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms