Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms