Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms