Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms