Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700066B19RikQ3TS39 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700066B19RikQ3TS39 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms