Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms