Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms