Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp39Q3TIX9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms