Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde12Q3TIU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde12Q3TIU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms