Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc13Q3TIR1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms