Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms