Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Jmjd8Q3TA59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms