Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jsrp1Q3MI48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jsrp1Q3MI48 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms