Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb38Q3LR78 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbtb38Q3LR78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms