Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm3Q32NY4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnnm3Q32NY4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms