Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col24a1Q30D77 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms