Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam178bQ24JP3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms