Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne9Q1RLL3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne9Q1RLL3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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