Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam171bQ14CH0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms