Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptcd3Q14C51 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptcd3Q14C51 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms