Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf3ip1Q149C2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms