Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtel1Q0VGM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms