Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc39dQ0VF76 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms