Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms