Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rundc1Q0VDN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms