Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hif3aQ0VBL6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms