Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb8Q0VBD0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms