Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrioQ0KL02 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms