Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2bQ0KL01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms