Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf541Q0GGX2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms