Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcnt1Q09324 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcnt1Q09324 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms