Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms