Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Pou6f1Q07916 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Pou6f1Q07916 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Pou6f1Q07916 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Pou6f1Q07916 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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