Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a2Q07643 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms