Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrstQ06666 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms