Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp2Q06649 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms