Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Thbs3Q05895 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms