Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk16Q04735 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms