Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcad1Q04692 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcad1Q04692 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms