Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnd1Q03719 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnd1Q03719 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms