Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnb1Q03717 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms