Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff2Q03404 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff2Q03404 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff2Q03404 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms