Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thbs2Q03350 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms